《MacTalk 跨越边界》

“贝叶斯定理是贝叶斯推断的应用,是英国数学家托马斯·贝叶斯在1763年首次提出的。”
“P(A|B) = P(B|A)P(A)/P(B)”
“事件B发生的情况下事件A发生的概率等于事件A发生的情况下事件B发生的概率乘以事件A发生的概率,然后再除以事件B发生的概率。”

“KISS(Keep It Simple, Stupid),简单即为美。”

“我不能证明这件事是正确的,但我可以证明它是错误的。”

“第十人理论,如果我们九人读相同的信息,而得出同样的结论,第十人要做的就是提出异议,不管看上去有多不合理,第十个人得考虑另外九个人都错了的特例。”---《僵尸世界大战》

“丁香园的产品经理、微信公众号“二爷鉴书”的作者邱岳,曾经说过一句迄今为止最有价值的话:产品经理最重要的能力不是某一项技能,而是“让正确的事情相继发生”。”

“关于生命的意义,林纳斯的解释是,有三件事具有生命的意义。它们是你生活当中所有事情的动机。第一是生存,第二是社会秩序,第三是娱乐。生活中所有的事情都是按这个顺序发展的,娱乐之后便一无所有。”

“事实上,所有的程序都是在制定规则,只不过操作系统是在制定最根本的规则。——林纳斯”

“Talk is cheap, Show me the code。”——林纳斯

《病毒来袭》

2020年春节,新型冠状病毒爆发,全国严控,在家读完这本关于病毒的书籍。书中有一个马丁·里斯的神预言(见如下摘录)。

“基本再生数:对任何流行病来说,R0是每一例新病例所造成继发感染数量的平均值(在无事先免疫和防控举措的情况下)。如果每个新病例平均引发一人以上的继发感染,那么该流行病就有可能扩散。如果每个新病例平均导致不到一人的继发感染,疫情就将逐渐消失。R0帮助流行病学家准确判断流行病是可能呈“病毒式扩散”还是逐渐消失,它基本上成为流行病的可扩展性的衡量指标。”

贝杰林克用一个可以过滤细菌的精细陶瓷过滤器对烟草病株汁液进行过滤,发现传染健康植株的能力未减,从而意识到一种比细菌更小的生命形式会导致疾病,他将这一新型生物体命名为virus(病毒)。

“安东尼·列文虎克(Antonie van Leeuwenhoek)利用纺织商使用的镜片,制造了第一架显微镜,第一次观察到了细菌。”

重叠读框现象:两个编码不同基因的读框利用同一段DNA序列的现象。

“奥卡姆剃刀定律(Occam’s razor,即简单有效原理)应该指引我们得出结论:我们因共同的遗传而拥有共同的特征。”

“微生物跟有毒物质一样,有适应不同层级食物链的潜能,这一过程被称作生物放大作用(biological magnification)。”

“艾滋病毒源于黑猩猩的捕食。”

“逆转录病毒:逆转录病毒在RNA上存录遗传信息,在能够将自己插入宿主的DNA之前,将其转录成DNA。之后逆转录病毒按生命周期运行,创造自己的子代病毒。”

“微生物库:每个物种都有一个特定的微生物库,里面包含病毒、细菌和寄生虫这些能将该物种视为家的所有不同种类的微生物。虽然某物种里的一个动物在某一时刻不可能携带微生物库里的所有品种,但这一术语可以作为一个概念性工具来测量物种的微生物多样性——所感染微生物的范围。”

“人类祖先的那种低种群密度会对感染源的传递产生显著影响。传染源需要四处扩散,如果种群规模小,感染源就很难传播。科学术语将种群规模的大量减少称为种群瓶颈(population bottlenecks)。当出现种群瓶颈现象时,物种会失去微生物多样性。”

“我把种群瓶颈对微生物库的削弱作用称为微生物净化(microbial cleaning)。”

“分类传播原则:分类传播原则认为,两个物种的亲缘关系越近,一种微生物在两者之间成功流动的可能性就越大。”

“储主(reservoir)——供养病毒的动物。”

“该朊病毒在人类中被发现时,同样的疾病被称为变异型克雅氏征(variant Creutzfeldt-Jakob disease, 简称vCJD)。”

“巴厘岛和龙目岛之间的海峡,正好位于华莱士线上。这一著名的地理分界线是以19世纪英国生物学家阿尔弗雷德·拉塞尔·华莱士(Alfed Russel Wallace)的名字命名的。他与查尔斯·达尔文共同提出了自然选择理论[1]。虽然巴厘岛和龙目岛之间的距离,并不比印度尼西亚群岛几百个岛之间的很多航道长,但华莱士发现航道两边的动物种群有很明显的差别。”

“在伦敦皇家学会(Royal Society of London)前任会长马丁·里斯(Martin Rees)提出的一条著名预言里,他警告道:“……到了2020年,一场生物学差错或者生物恐怖袭击就将杀死100万人。””

变异型克雅氏征(variant Creutzfeldt-Jakob disease, 简称vCJD):变异型克-雅二氏病(Variant Creutzfeldt–Jakob disease,vCJD)是传染性海绵状脑病中的一种。[5] 临床表现包括精神疾患、行为改变和感觉迟钝。[1] 疾病的潜伏期仍不清楚,一般认为潜伏期为多年。[2] 临床症状出现后的预期寿命大约是13个月。[1]

“基因变化:基因变化有多种方式:基因突变提供了一个缓慢而稳定地生成新基因的重要机制;基因重组和基因重配让病毒有能力迅速获得全新的基因身份。”

“新兴的基因:两个微生物,一个旧的和一个新的,能够暂时在一个宿主体内相互接触,交换基因物质。孕育出的改良感染源有可能向外扩散,并引发一场全新的流行病,完全令人措手不及。实际上引发流行病的是新交换的基因信息,而不是一种新的微生物,因此采用术语“新兴的基因”。”

“虽然1854年以前地图已被广泛使用,但他绘制的索霍区地图无论在流行病学上,还是绘图学上都属创举。他是第一位利用地图从地理学角度分析相关事件,并由此得出因果结论的人。此举使斯诺被誉为地理信息系统(geographic imformation system, 简称GIS)使用第一人。”

“该技术由他的博士生导师、斯坦福生物化学家派特·布朗(Pat Brown)开发。布朗发明的DNA微阵列芯片(DNA microarray chip),是在一个小玻璃片上以阵列形式分布的成千上万个不同的、细小的人工合成基因序列。因为样本基因信息与预设基因序列粘在一起,如果用药液冲洗置于载玻片上、含有基因信息的样本,那么与载玻片上预设基因序列匹配的样本基因将会溶解。这样你就可以通过识别载玻片上哪些预设基因序列诱捕了其自然界的兄弟姐妹,来确定样本里有些什么基因序列。”

“减毒活疫苗:减毒活疫苗是我们在实验室培养的活病毒,致命性有所减弱,效用不变。”

“病毒灭活疫苗:病毒灭活疫苗中的病毒自身失去繁殖能力,但仍然能够激起适当的免疫反应,所以它们仍旧是病毒。”

“微生物学家自己预防传染病的方法:
1.接种最新的疫苗;
2.乘坐地铁和飞机后要洗手;
3.与人握手后尽快洗手;
4.尽量不用手碰鼻子和嘴;
5.尽可能保证饮食卫生;
6.减少不安全性行为的风险。”

“风险素养:风险素养即区分不同程度风险的能力,这不只是对政策制定者的要求。对自然疾病的有效应对,需要依靠每个民众和他们保持镇静并听从指挥的程度。”